符合香港高才通计划的内地高校从最初的九所扩员到了23所，其中包括了“C9”全体成员，外加北京航空航天大学、北京理工大学、北京师范大学、中南大学、南开大学、武汉大学、华中科技大学、中国人民大学、四川大学、东南大学、中山大学、天津大学、同济大学等13所985高校以及一所“双一流”大学——中国科学院大学。从名单来看，高才通计划已经包括了大多数985高校，不过也仍有17所没能入列，其中包括华东师范大学、华南理工大学、大连理工大学等。