皇太极三征察哈尔林丹汗，漠南蒙古归附，奠定清朝北疆格局。

1627 年正月，刚继位的皇太极命阿敏率三万大军东征朝鲜。林丹汗并未趁后金东线用兵东征，而是率部西征蒙古右翼各部，试图以武力整合分散的蒙古部落，强化自身汗权。

林丹汗的高压征伐引发右翼各部强烈不满。
1628 年初，喀喇沁、鄂尔多斯、阿巴噶、土默特等部组成联军，在赵城与林丹汗部交战，察哈尔驻兵损失惨重。战后蒙古右翼各部自知无力单独对抗林丹汗，转而向后金遣使求援。

主动权就此转到皇太极一边。1628 年二月，皇太极以察哈尔多罗特部截杀后金使臣为由，亲率精锐突袭多罗特部，俘获人口一万一千二百人，取得首战胜利。
同年七月，喀喇沁等部正式与后金会盟，约定共击林丹汗。

同年九月，皇太极首次统领满蒙联军西征察哈尔，大军攻入察哈尔属地锡尔哈锡伯图等地，俘获大量人畜。林丹汗率主力西撤，联军扫荡察哈尔东部牧地后班师。
经此一役，察哈尔外围部落大多归附后金，林丹汗势力范围大幅收缩。

1632 年三月，皇太极召集归附蒙古各部会盟，发动第二次大规模西征，满蒙联军总计十万人。
林丹汗闻讯后自知不敌，率部众放弃本土西迁，一路退至河套地区，又渡黄河逃往青海方向。

皇太极率军追击至归化城，也就是如今的呼和浩特，分兵扫荡大同、宣府边外的察哈尔残余属地。确认林丹汗已远遁青海、追击难以奏效后，大军在宣府、张家口一带收缴边外人口牲畜，随后启程返回盛京。

此次西征彻底瓦解了林丹汗的核心力量。林丹汗西逃途中部众不断离散，补给日益困难。
他曾试图联络外喀尔喀却图汗、西藏藏巴汗、康区白利土司等势力组成联盟，谋求重整势力，但始终未能扭转颓势。

1634 年，林丹汗在青海大草滩染上天花病逝。他的遗孀与儿子额哲率余部返回河套地区驻牧，漠北车臣汗有意接纳这部余众，借蒙古汗统名义扩充自身影响力。

1635 年二月，皇太极派多尔衮、岳托、萨哈廉、豪格率一万满洲骑兵第三次西征察哈尔。
四月下旬，后金军渡过黄河找到察哈尔余部驻地，额哲与林丹汗遗孀走投无路，率部正式投降，还献上元代传国玉玺。

传承四百余年的蒙古汗统至此终结。经三次用兵，漠南蒙古各部尽数纳入后金管控体系，后金随后增设蒙古八旗，军力与战略空间大幅扩张。
明朝北方防线完全暴露在满蒙骑兵面前，为后来清军入关创造了地缘条件。

不久皇太极遣使招抚漠北喀尔喀三部。喀尔喀本为达延汗分封的六万户之一，明朝后期分化为土谢图汗、车臣汗、札萨克图汗三部。接到后金招抚后，三部先后表示臣服，向后金纳贡。

1636 年三月，蒙古十六部首领在盛京会盟，共同推举皇太极为博格达彻辰汗。
清朝皇帝自此兼具蒙古大汗的法统身份，这一身份成为后来清廷治理漠北、西域、青海、西藏等边疆地区的重要政治基础。

皇太极时期，喀尔喀、卫拉特、和硕特等部的臣服仍属名义范畴。
到康熙年间，清廷通过军事征讨与制度化治理，逐步将这些地区的名义臣服转化为实际管控。