综合来看，四川大学整体排名靠前，学科实力上川大更占优势。两所都是西南地区顶尖985高校，但发展定位与学科布局差异明显。

川大由原四川大学、华西医科大学合并组建，学科门类齐全，覆盖文、理、工、医。王牌学科众多，医学尤其强势，口腔医学全国顶尖，临床医学、材料、文学等学科实力突出，学科评估A类学科数量多于重大，综合规模和学科广度更强。

重庆大学以工科见长，土木、建筑、机械、电气工程是传统优势学科，工科底蕴深厚，在基建、电力行业认可度很高，但缺少医学学科，学科门类相对单一。

在录取分数、综合榜单上川大通常更高。不过选择时不能只看强弱，侧重医学、文科、理科优先选川大；想学电气、土木、建筑这类工科，重庆大学是很好的选择。两所院校各有特色，适合不同方向的考生。