西南医院是陆军医科大学的附属医院，西南医科大学附属医院是位于四川泸州市的一所三甲综合医院，西南医院属于部队院校直属的部队医院，西南医科大附属医院是地方院校的附属医院，二者实际上没有可比性。
西南医院和西南医科大学附属医院，都有“西南”两个字，但根本不是一回事，为了这“西南”二字，西南医院在西南医科大学刚更名时，还发生一段不为人知的故事。当然这个故事就是围绕西南二字的更名权而展开的。
现在的西南医科大学，以前的名字可没有这么高大上，而是四川一所普通的医学院，原名为泸州医学院，位于四川省的泸州市。泸州市当时最拿的出手的名片就是泸州老窖，再就是泸州医学院。
泸州医学院是一所省属的高等医学院校，地处川南的泸州市，辐射云贵川渝四省市交界的地方，也算是四川的一个区域性医疗中心。但由于学校名字和所承担的地位不协调，于是决定改名为四川医科大学，结果遭到了四川大学以及华西医院的反对，泸州医学院因改名而将自己推上风口浪尖。
第一次改名失败，但没有动摇学校再次更名的决心，2016年1月17日，泸州医学院正式更名为西南医科大学，这个名字比之前的四川医科大学更为霸气，由四川变更为西南，四川大学和华西医院是出了大力气的，没有他们的反对，那可能还是四川医科大学。
西南医科大学校名坐实以后，位于重庆的陆军军医大学坐不住了，他们认为陆军军医大学的附属医院为西南医院，西南医科大学简称西南医大，附属医院为西南医大医院，这很可能会让患者与西南医院产生混淆，同时对于医院品牌、声誉等产生影响。
于是西南医院中国工程院院士牵头，上书教育部反对更名。但西南医院及陆军军医大学官方并没有出面，泸州医学院这次更名坐实。现在时间已经过去了五年多，西南医科大学正以崭新的姿态屹立于四川南部，西南区域医疗中心的位置再次得到巩固，而且是名副其实。
西南医科大学成功更名以后，于是有人就开始将西南医院和西南医大附属医院进行比较，当然这是没有可比性的。这从两家医院的简单介绍中可以得到答案。
从学校来比较。
陆军军医大学，一所承载着辉煌历史和光荣传统的全国重点学府，军队建设的璀璨明珠，更是国家首批博士学位授权单位，开创八年制医学教育新篇章的先驱。
2017年，以第三军医大学为基石，融入白求恩医务士官学校、西部战区陆军综合训练基地军医训练大队、解放军第八医院、解放军第二六〇医院、解放军第三二四医院等优质资源，形成了覆盖重庆、河北石家庄、新疆呼图壁、西藏日喀则的宏大格局，占地面积达9079亩。
这里，陆军军医大学第一附属医院（西南医院）、第二附属医院（新桥医院）、陆军特色医学中心（大坪医院）、士官学校附属医院、陆军第九五三医院、陆军第九五八医院等医疗机构，如璀璨的明珠镶嵌在各地，守护着人们的健康。西南医科大学，作为四川省的瑰宝，是一所享有盛誉的普通高等院校。自1978年升格为本科院校并更名为泸州医学院以来，它不断追求卓越，于1982年获得学士学位授予权，1993年成为硕士学位授予单位，2001年开始联合培养博士，2004年起开展留学本科生学历教育。
2010年，它更是荣获设立博士后科研工作站的殊荣。2015年，更名为西南医科大学，再次彰显了其深厚的学术底蕴。如今，它已成为博士学位授予单位，拥有直属附属医院5所，为医学事业注入了新的活力。
从医院来比较。
西南医院，这座医学的殿堂，以其60个临床医技科室和2900张床位，书写着对生命的敬意。在2019年的忙碌中，它接纳了414.7万人次的门急诊量，治愈了14.6万人次的疾病，执行了11.4万台次的手术，每一刻都在为缩短那平均住院日5.93天而努力。
医院的仪器设备总值高达22亿元，其中包括“达芬奇”手术机器人、术中核磁、7.0 T核磁共振等尖端设备，宛如现代医学的魔法棒，为疾病带来希望的曙光。
西南医院不仅在设备上领先，更在学科和人才上展现出雄厚的实力。医院拥有12个国家重点(培育)学科，12个国家临床重点专科军队建设项目，更有军队“双一流”重点学科和14个军队医学专科中心，其中7个全军研究所、7个全军专科（专病）中心，共同筑起了医学的高峰。在2020年复旦大学医院排行榜中，西南医院更是荣登全国第25位。医院的人才济济，中国科学院院士、三级以上教授、南丁格尔奖章获得者等人才汇聚一堂，他们像星辰大海中的璀璨明星，引领着医院前行。
西南医科大学附属医院，同样承载着医学的使命，自1950年8月创立以来，一直为川渝滇黔四省市的近6000万人民提供医疗服务。
医院有两个院区，忠山和康健中心，共设有4200张床位和65个临床、医技科室。2022年，全年门急诊达到了244.2万余人次，出院13.4万余人次，手术4.5万余人次。这里的医生和护士们，像守护者一样，默默地守护着每一位患者的生命健康。
医院有职工近4600人，其中专业技术人员4200余人，博士、硕士1500余人，高级职称600余人。这些优秀的医学人才，是医院最宝贵的财富，他们用自己的智慧和汗水，为医学事业做出了巨大的贡献。
在2021年度复旦版《中国医院排行榜》中，西南医科大学附属医院在西南地区医院综合排行榜上名列第14名；2022年度中国医院科技量值排行榜（STEM）中，更有24个学科上榜，展现了医院在科研和临床方面的卓越实力。
综上所述，无论是医院的综合实力，还是专家数量、病床数量、就诊人数，品牌建设等，西南医院比西南医科大学附属医院更强。但西南医科大学在四川也是仅次于华西医院，四川省人民医院之后第三大省级医疗中心。
